Pour venir à bout des boss de Mega Man 2 plus facilement et ainsi obtenir les bonus et power-up plus rapidement, il est conseillé de les affronter dans l'un des ordres suivants :

• Metal Man → Wood Man → Air Man → Bubble Man → Heat Man → Crash Man → Flash Man → Quick Man

OU

• Wood Man → Air Man → Crash Man → Quick Man → Metal Man → Flash Man → Bubble Man → Heat Man

OU

• Flash Man → Quick Man → Metal Man → Wood Man → Air Man → Crash Man → Bubble Man → Heat Man