Après la scène tragique au jardin botanique, rendez-vous au GCPD, dans la salle des communications derrière l'agent Cash à droite pour intercepter la communication de Jim Gordon, qui a apparemment décidé de régler son compte à l’Épouvantail par ses propres moyens. Avant de ressortir du commissariat, allez récupérer le fusil électrique au fond de la salle des preuves en brisant le verre de la vitrine, reprenez le large en dézinguant les tanks qui vous attendent à la sortie du GCPD et rendez-vous dans les bas-fonds pour rejoindre votre objectif. Passez par la trappe de service au milieu de la rue, coupez l'électricité avec votre fusil éponyme en envoyant une charge négative sur le générateur, puis utilisez le synthétiseur vocal pour forcer un soldat à ouvrir le volet.
Piloter la Batmobile à distance pour éliminer les mercenaires, bidouillez le panneau électrique au fond à droite après être remonté dans la rue pour ouvrir un second volet menant au grand atrium de ventilation, tirez avec le canon de la Batmobile dans la paroi friable droit devant et actionnez la manette pour abaisser les plots qui bloquaient votre véhicule. Accrochez-le au plafond avec le treuil pour le faire descendre gentiment à la verticale, tirez un coup de canon vers la paroi friable au plafond, montez pour tirer plusieurs coups de fusil électrique dans le générateur avec le bon timing pour éviter les parois qui pivotent, puis prenez le contrôle de la Batmobile pour tirer depuis le rebord sur les soldats au niveau inférieur, maintenant que les premières hélices sont arrêtées.
Rejoignez ensuite le niveau inférieur en question, grimpez au grappin sur la droite pour vous laisser tomber dans la cage d'ascenseur et dans la cabine, faites-la descendre en tirant au fusil électrique dans le générateur et posez du gel explosif sur la paroi pour pouvoir passer. Utilisez votre fusil électrique sur les soldats qui vous accueillent pour neutraliser leurs matraques et pouvoir les neutraliser, actionnez la manette et dirigez-vous sur la droite. Grimpez sur la gauche, tirez au fusil électrique dans le générateur pour éliminer la grappe de soldats, actionnez la manette au fond pour ouvrir l'ascenseur et pouvoir faire descendre la cabine au fusil et arrivé en bas, grimpez sur le toit jusque dans l'alcôve sur le côté.
Faites remonter la cabine, passez en dessous, passez par la grille de ventilation en hauteur et glissez-vous au fond de la pièce en restant en hauteur. Laissez-vous tomber derrière le voile, neutralisez le soldat équipé du gilet, puis entreprenez de mettre KO tous les autres soldats en hésitant pas à mitrailler ceux qui sont équipés de matraques avec le fusil électrique pour pouvoir tabasser le reste en paix. Le calme revenu, récupérez les Trophées cachés dans la pièce (derrière le rideau près de l'entrée et au dessus du néon mauve « Lounge Bar »), trafiquez le panneau électrique pour ouvrir la porte et laissez-vous tomber au fond du trou pour avancer vers la tourelle que vous apercevez à droite.
Piratez-la pour pouvoir passer dans la cage d'ascenseur à droite sans danger, grimpez au grappin et détruisez le générateur avec votre fusil électrique. Dès lors, puisque la tourelle en contrebas vous bloque la voie du retour, utilisez la télécommande pour amener la Batmobile le plus bas possible, utilisez le treuil sur l'une des attaches pour faire s'enfoncer la foreuse et allez détruire la tourelle qui vous a offensé. Montez dans votre tank personnel, faites remonter la foreuse pour pouvoir détruire la paroi et passer dans l'ouverture du même coup, puis remontez les tunnels en passant à côté ou au dessus des obstacles. Sitôt passé la rampe en bout de course, le Chevalier d'Arkham vous prend en chasse avec une foreuse géante qui n'a rien à envier à celle de Total Recall.
Faites donc rapidement demi-tour pour faire face à la route en partant en trombe et fuir vers la sortie chargée d'explosifs, puis manœuvrez dans les tunnels en vous plaçant près de l'un des trois chemins dont l'extrémité est marquée en orange. Assurez-vous d'être suivi par la foreuse géante avant de vous engager dans chacun de ces tunnels et de foncer vers la rampe finale, envoyant ainsi votre poursuivant s'échouer dans les explosifs. Les trois tunnels dûment empruntés, dirigez-vous vers la sortie, utilisez le treuil pour ouvrir la trappe au plafond et expédiez-vous de votre véhicule pour éviter de finir broyé avec. Utilisez le grappin pour monter, déclenchez une multi-élimination depuis le conduit en visant les soldats blancs en priorité et terminez de faire le ménage pour pouvoir sauver Gordon... ou tenter de le faire, du moins.
Le Chevalier d'Arkham surgit en effet et vous met en joue, ce qui donne suite à une large partie de cache-cache en plusieurs étapes : votre adversaire ira en effet se poster en position de sniper en hauteur et épiera la zone, guettant la moindre occasion de vous truffer de plomb, et chaque fois que vous arriverez à le rejoindre, le bougre prendra la poudre d'escampette en appelant des renforts et en ouvrant chaque fois une nouvelle zone. Pour commencer, accrochez-vous au rebord en attendant le bon moment pour grimper et rejoindre le Chevalier au grappin, éliminez les soldats qui font irruption en vous méfiant du drone et en ne vous approchant pas de la zone surveillée par JT. Approchez-vous ensuite de lui en passant par le niveau inférieur, utilisez le grappin pour rapidement grimper au rebord le plus proche de lui et vous cacher et montez le confronter à nouveau sur son perchoir.
Passez alors rapidement dans la petite ouverture carrée dans le volet métallique qui vous bloque autrement dans une zone sur le point d'être gazée, puis remettez le couvert en éliminant soigneusement les nombreux soldats qui interviennent en faisant attention aux mines qu'ils déposent au sol. Si le drone vous fait des misères, neutralisez-le temporairement avec un coup de fusil électrique, passez toujours par le niveau le plus bas pour vous approcher avant de remonter directement vers JT et sortez à nouveau de la zone qui se referme. Pour franchir la dernière zone, après avoir fait le ménage en attirant les soldats loin de la zone à risque, cachez-vous derrière les caisses au centre en guettant le bon moment pour vous glisser sur la droite et concluez cette confrontation avec le Chevalier
Allez libérer Gordon, donnez une raclée aux soldats qui sortent de l'ascenseur en faisant bon usage de votre fusil électrique, puis assistez impuissant à la scène qui se déroule sur le toit.
