Bon alors, SPOILEEEEEEEEERS on sait jamais.
NieR peut avoir plusieurs origines :
-Déjà on sait que Yoko Taro aime utiliser des langues particulières pour ses personnages, suffit de voir Grimoire Noir et son nom Français. On a donc en français le verbe "Nier" qui indique qu'on se cache plus ou moins volontairement quelque chose. Tout comme les personnages se cachent la destruction de l'humanité et comme Nier lui-même nie ses mauvaises actions en fin de jeu afin de sauver sa fille.
-Il y a également la ressemblance avec le mot anglais "Near" qui signifie "proche" et une phrase assez courante chez les alarmistes "The end is near" (La fin est proche) -> "The end is Nier" comme Nier sonne la fin de l'humanité.
Quant au R majuscule, je pense que c'est parce que NieR nous montre le début de l'épidémie avec les Légions, donc le N en début de mot et la fin de tout, l'humanité et les Replicants, donc le R majuscule en fin de mot. Après, grosse interprétation, je peux tout à fait me gourer.