Il faut préciser que les équipes de Nintendo se sont appuyées au départ sur le moteur de Super Mario 64 pour réaliser les premières étapes de Zelda 64 et qu'une partie des troupes participa au développement des deux jeux. Mais le titre était pensé à l'origine pour exploiter les possibilités du périphérique N64DD (Nintendo 64 Disk Drive) qui s'imbriquait sous la console pour élargir les données de stockage liées aux jeux N64 afin d'y apporter des modifications.

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